香港醫學博物館於1996年由香港醫學博物館學會成立，是一所獨立自資營運開放予公眾參觀的博物館。博物館所在的建築物是舊病理檢驗所，是香港法定古蹟之一，香港政府以特惠方式租予香港醫學博物館學會。

使命與願景
香港醫學博物館的使命，旨在提供具啟發性的環境，促進公眾對過往、現今和將來有關健康及醫學常識的教育，讓本地與海外訪客能欣賞到香港豐富的醫學遺產，包括傳統中醫及西方醫學；並成為醫學歷史研究、保存及展出香港醫療與健康科學發展等文物的中心。

我們的願景是成為一所傲視全港以至國際同儕的醫學博物館，就在這位處香港史上力抗傳染病的地點，把歷史事蹟一一活現眼前，並揉合起歷史教訓和健康課題，別出心裁地向公眾呈現；更與其他機構及組織攜手合作，為不同年齡人士提供高質素的教育及文化活動，增進公眾對維持健康的認識，激勵他們勇對未來的挑戰。